建筑师Castilho于1517年接管该修道院的建筑工程,他渐渐地把该修道院曼努埃尔式的建筑风格构思改为文艺复兴建筑风格。1550年,建筑师Torralva加入了主教堂、唱诗班的席位,并完成了该修道院内两个楼层的工程,仅采用文艺复兴的建筑风格。他的工作于1571年由Rouen完成,他最后在建筑中加入了一些古典的元素。 1755年,哲罗姆派修道院在经历大地震的洗礼后,仍然屹立不倒,且更甚的是,它并没有什么损毁。1833年,葡萄牙的教会宣布停止使用哲罗姆派修道院。这以后,它开始年久失修,而其墙壁亦已开始严重断裂。西南方的塔后来被加上一个圆顶(cupola)。
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