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代谢组学研究中使用的高通量方法会产生大量代谢分析相关数据, 这就需要采用生物信息学的方法进行处理。百泰派克公司生物信息学分析人员能够对代谢组学数据知识进行深度挖掘和全面分析，从质谱原始数据出发，进行峰对齐、保留时间校正和峰面积提取。代谢物结构鉴定采用精确质量数匹配（<25 ppm）和二级谱图匹配的方式，检索METLIN数据库和 HMDB 数据库；两组比较时，删除两组组内缺失值均>50%的离子峰；接着对数据进行归一化（采用 autoscaling或UV法）。百泰派克应用 MetaboAnalysis、SIMCA-P软件进行**统计分析和单维统计分析，包括PCA、PLS-DA、OPLS-DA、以及通路富集分析，确保提供全面精准的代谢组学分析结果。
; V2 y( t( G+ J: O: L0 [ 代谢组学生物信息学分析代谢组学数据质量评估 2 k9 ^0 C4 ~ S
9 E. b$ i9 Z- j2 F! B
主成分分析（PCA） # f/ e( F) O5 _0 C3 q. [( j, B
, ]7 Q+ R- [ V4 Q2 @, h* w% }7 t! I) l8 U+ F1 y# H
PLS-DA/OPLS-DA二维图 # `* u* ]$ l* c- i$ n/ V3 W1 m: m6 Q
# [4 M6 K- O0 V/ r
数据归一化分析 % m& w8 H, g' K. K$ n( q
7 o- D+ k8 B: [3 h单变量统计分析
( _$ ~" } Z6 |7 I# Q2 O- y3 T6 Z! J7 }
差异代谢产物聚类分析
( E/ T9 @2 q* l- W) U' }$ y0 K" O7 p+ a* |0 ]- _1 e0 {& s
8 Y( {" i- ~3 ?) ^% `* e* j
KEGG差异代谢产物通路分析
( {: ]6 Q1 i: q
* O- f* o7 o$ ?5 N- V5 v) H6 p2 C1 m7 K% F o: {$ Q+ E/ B
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狗仔卡
发表于 14.8.2020 04:51:40
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